교토와 네리마의 격전을 극복하고 라세츠 학원의 학생인 시키 일행은 조금씩 성장해 간다. 하지만 야오로시는 동료의 소중함을 가르치는 무다노에게 반발. 귀국대 대장 토도로키 하야테가 내세우는 ‘모모타로 완전 말살’에 공감해 라세츠를 떠난다. 귀국대의 신념은 비전투원도 살해 대상이 된다. 그 사실을 눈치챈 시키는 무다노, 학생들과 함께 야오로시를 쫓는다. 목적지는 닛코. 얼마 전부터 케곤 폭포가 멈추고 거대한 연구소가 세워져 있었다. 그곳에선 무서운 실험이 행해지고 있었는데...
